1)Свой Скрипт подключать нужно в конце перед закрытием тела body. 2) в подключение попробуй defer прописать. Например 3) В файле скрипта обернуть код в функцию window.onload = function () { alert("Проверка работы js") ; }
Путь до стилей или до скриптов берутся не от корня системного диска а от расположения главного файла т. е от index.html К примеру мы имеем такую структуру как на скриншоте то путь будет как на втором скриншоте