При запуске программы миграции, разделы блокируются (понятно для чего). Когда перенос удачно закончится, программа должна разблокировать разделы. Если этого не происходит, получаешь сообщение об ошибке и предложение перегрузиться - тогда блокировка снимется. В противном случае (до перезагрузки) банально не будет доступа к разделу. А вообще-то, подобные дела нужно делать загрузившись с диска, на котором есть программа для переноса. Нормальные программы имеют функцию создания загрузочного диска. А некоторые, сразу после установки, предлагают его создать.