1) Если не требует прав администратора, то программа не будет что-либо прописывать в системные папки и реестр. Если требует, то будет. 2) В свойствах файла, к примеру, Adobe Acrobat отображает в настройках программу, где файл был сделан. Программа может вносить, а может и не вносить данные.