Во-первых, Надо знать как устроен установщик линукса. Для этого требуется знания и опыт в этом. С уверенностью скажу что старые версии дистрибутивов, однозначно игнорировали Винду, или вернее задаст один вопрос - обнаружена операционка Шо затираем? Да или Нет. Во-вторых, при установке выбирается физический диск. Если в системе ДВА физических диска, то с этим проще, особенно если на одном из них запилен NTFS с виндой. Ведь линух не работает с чужой фс. Но, GRUB может предложить "подмять" под себя винду,. И ты либо соглашаешься либо нет. GRUB - это линуксовский загрузчик разных операционок.