Потому что при установке винды нужно было отключить остальные диски, чтобы установщик создал на SSD новый загрузчик, а не воспользовался старым. Переустанавливай, если данных важных на SSD нет. И при установке снеси с SSD все разделы и ставь в образовавшуюся после этого неразмеченную область, чтобы установщик по-новой его нормально разметил.